GIF还有一个重要特点就是支持背景透明，这使其可以与网页的背景很好的融合。大家也可以在关闭背景图层的前提下输出透明背景的GIF。不过GIF的背景透明只能是两种状态，要么全透明，要么全不透明，而不能是介于两者之间的半透明。因此除非图像的边界是水平、垂直、45度斜线这三种情况，否则都会因为透明而形成明显的锯齿。如下图所示是一组不同边界的图形在不同背景色下的表现。从中不难看出两者的区别。
需要注意的是，边缘的锯齿的形成原理并不只是图像的问题，也有显示器物理局限的因素，相关知识在基础教程中提到过，可点此观看相应内容。
对于带有半透明像素(如投影样式)的图像而言，若要保存为透明背景，则需要开启透明度抖动项目，这样可以用微小的疏密不同的散点来模拟半透明。如下图所示即是。可看出在“无透明度仿色”下的GIF尽管也是背景透明，但在原先半透明的部分仍然保留有白色，这样只能适用于白色背景之上。而后者可适用于任何背景之上。如下右图所示。
需要注意的是，透明度仿色并不是一个完美的解决方案，甚至可以说是一个非常差的解决方案。但出于GIF本身对于透明度的限制而言，也是一种解决之道。在实际的制作中，如果确定要使用GIF格式，则应避免在图像的边界生成半透明像素。换言之就是尽量避免使用透明度仿色。
还有一点要注意的是，如果输出的动画是透明背景的，则可能改变在非透明状态下各帧的运算关系，也可能导致动画的字节数有所增加。
现在我们来简要说说将动画用作手机彩信的用途。
